Thành lập năm 1956, trên cơ sở tách ra từ xã Xuân Trường(nay gồm hai xã Thụy Xuân và Thụy Trường), huyện Thụy Anh(nay là huyện Thái Thụy)

Trong quá trình hình thành và phát triển, xã Thụy Xuân đã trải qua nhiều thời kì lịch sử khác nhau. Căn cứ vào các tư liệu lịch sử chính thống của các triều đại phong kiến Việt Nam cùng các văn tự trên bia đá, sắc phong, thần tích trong các đền chùa, gia phả của các dòng họ, có thể xác định được rằng mảnh đất Thụy Xuân được hình thành từ hàng nghìn năm trước, nằm ngoài con đê cổ có tên Ngự Hàm (con đê được đắp từ thời Lí-Trần). Chính vì vậy, có thể hiểu sự hình thành tên đất, tên làng có từ thời Lí-Trần.

Mặt khác, căn cứ vào các sử liệu chính thống của các triều đại phong kiến, vào đầu thế kỷ XIX, thời vua Gia Long nhà Nguyễn, Thụy Xuân nằm trong tổng Vạn Xuân- huyện Thụy Anh- phủ Thái Bình- trấn Sơn Nam Hạ- nước Việt Nam. Năm Minh Mạng thứ 12 (tức năm1832), thành lập tỉnh Nam Định, sáp nhập các xã thuộc huyện Thụy Anh vào tỉnh này, trong đó có Thụy Xuân.Đến năm Thành Thái thứ 2(tức năm 1890), thành lập tỉnh Thái Bình, Thụy Anh thuộc về Thái Bình- nước Đại Nam

Trước Cách mạng tháng Tám,xã thuộc tổng Vạn Xuân- huyện Thụy Anh.Tháng 10 năm 1947, thực hiện nghị quyết của Ủy ban nhân dân tỉnh Thái Bình, huyện Thụy Anh thành lập một liên xã mới gồm các làng Vạn Xuân, Phấn Vũ, Bình Lạng, Tam Tri, Chỉ Bồ và Lỗ Trường.

Năm 1956,tỉnh Thái Bình tiến hành cải cách ruộng đất, các xã thuộc huyện Thụy Anh được chia nhỏ, lấy chữ đầu của huyện thành chữ đầu của xã. Vì vậy xã Xuân Trường tách thành hai xã: Thụy Xuân và Thụy Trường. Từ đó đến tháng 4 năm 1976, Thụy Xuân gồm 11 xóm,3 thôn: Vạn Xuân, Phấn Vũ, Bình Lạng.Từ tháng 4 năm 1976 xã có 12 xóm từ xóm 1 đến xóm 12.Từ ngày 25 tháng 8 năm 2003 đến nay, xã gồm 8 thôn Bình Xuân, Bình An, Vạn Xuân Nam, Vạn Xuân Đông, Phấn Vũ Nam, Vũ Đông, Minh Vũ và Xuân Bàng.